南昆士兰大学的农作物健康中心（CCH）的使命是提供为确保农作物健康，提高粮食安全和农场盈利能力的世界级的科研。研究中心领导的研究集中在澳大利亚夏季和冬季种植系统疾病的可持续管理。研究人员因其在选择抗性和耐性种质、流行病学、尖端农作物病害诊断、生物安全研究、生物控制以及农作物及其病原体的遗传学和基因组学方面的专业知识而受到国家和国际的认可。最新的ERA（澳大利亚卓越研究报告）评估将CCH在“农作物和牧草生产”和“微生物学”两个领域的研究成果评为“远高于世界标准”。

研究人员在农作物健康中心针对小麦、大麦、鹰嘴豆、高粱、大豆、绿豆、水稻、花生和甘薯等一系列农作物开展世界级研究，主要研究由真菌、细菌和线虫引起的农作物疾病。与昆士兰农业和渔业部（DAF）的合作是CCH成功的关键，该部门确保通过南昆士兰大学/昆士兰农业和渔业部大面积种植计划（BACI）向昆士兰农民提供实用的解决方案。此外，该中心还与一系列资助机构合作，包括谷物研究与开发公司（GRDC）、AgriFutures和澳大利亚国际农业研究中心（ACIAR）。

该中心的工作人员还在联合国世界气象组织（World Meteorological organization）和相关的综合干旱管理方案（Integrated dreak management Program）内大量参与国际干旱和农业气候研究与管理项目。

应用气候科学中心（CACS）的研究课题包括：

• 农作物病害管理
• 病原体基因组学和生物学
• 农作物病原体流行病学和生态学
• 害虫、病原体和杂草的生物防治和综合管理
• 生物安全研究